MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 12636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009641	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009641	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009641	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009641	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009641	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009641	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009641	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009641	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009641	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009641	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009641	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009641	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009641	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009641	C	6	6	2076	2081	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_009641	CTA	3	9	2095	2103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009641	TA	3	6	2123	2128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009641	TA	4	8	2131	2138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009641	ATAAAT	2	12	3299	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009641	ATTA	2	8	3324	3331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009641	T	6	6	3347	3352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009641	AAT	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009641	GCA	2	6	3392	3397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009641	TAA	2	6	3454	3459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009641	TTTAAA	2	12	3476	3487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009641	A	6	6	3544	3549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009641	A	6	6	3570	3575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009641	AATT	2	8	3580	3587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009641	A	7	7	3636	3642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009641	AT	3	6	3649	3654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009641	ATT	2	6	3680	3685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009641	AAG	2	6	3693	3698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009641	GTA	2	6	3701	3706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009641	ATT	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009641	TGG	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009641	ATTA	2	8	3799	3806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009641	TTCT	2	8	3889	3896	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009641	TCAT	2	8	3900	3907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009641	TGAAC	2	10	6982	6991	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009641	A	6	6	9677	9682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009641	AT	3	6	10628	10633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009641	TAT	2	6	10653	10658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009641	ATT	3	9	10673	10681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009641	ATT	2	6	10739	10744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009641	ACA	2	6	10755	10760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009641	ATA	2	6	10798	10803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009641	AAG	2	6	10858	10863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009641	TAA	2	6	12484	12489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009641	AT	3	6	12512	12517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009641	AG	3	6	12531	12536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009641	AT	4	8	12565	12572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009641	CTAC	2	8	12577	12584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009641	T	7	7	12716	12722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009641	A	6	6	12730	12735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009641	ACGT	2	8	12741	12748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009641	ATA	2	6	12755	12760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009641	ATT	2	6	12768	12773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009641	TA	3	6	14106	14111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009641	ATA	2	6	14148	14153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009641	GTG	2	6	14163	14168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009641	T	7	7	14185	14191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009641	AAC	2	6	14227	14232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009641	CAA	2	6	14280	14285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009641	ATG	2	6	14298	14303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009641	AGGAA	2	10	14349	14358	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009641	GTA	2	6	14386	14391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009641	GTAGG	2	10	14409	14418	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009641	GAT	2	6	14426	14431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009641	TCA	3	9	14467	14475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009641	AAC	2	6	14507	14512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009641	TAAA	2	8	14544	14551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009641	A	6	6	14549	14554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009641	TAT	2	6	14677	14682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009641	T	6	6	14682	14687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009641	TA	3	6	14694	14699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009641	AGG	2	6	14715	14720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009641	AAC	2	6	15889	15894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009641	TCA	2	6	15916	15921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009641	CTT	2	6	16060	16065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009641	T	7	7	16087	16093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009641	AGG	2	6	16099	16104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009641	AT	4	8	17084	17091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009641	TAAATC	2	12	17169	17180	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009641	AAT	2	6	17208	17213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009641	CA	3	6	17231	17236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009641	TTA	2	6	17282	17287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009641	AAT	2	6	22184	22189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009641	GAT	2	6	22196	22201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009641	AT	3	6	22239	22244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009641	TA	3	6	23734	23739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009641	AGG	2	6	23788	23793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009641	TGCT	2	8	23803	23810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009641	TCGAT	2	10	23817	23826	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009641	A	6	6	23836	23841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009641	AGA	2	6	23878	23883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009641	GAT	2	6	23887	23892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009641	AAG	2	6	23927	23932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009641	ATT	2	6	24019	24024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009641	TTC	2	6	24070	24075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009641	A	6	6	24076	24081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009641	A	6	6	24099	24104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009641	ATCT	2	8	24137	24144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009641	CGG	2	6	24195	24200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009641	T	6	6	24233	24238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009641	GCCT	2	8	24265	24272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009641	T	7	7	24341	24347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009641	ATATT	2	10	24355	24364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009641	AT	3	6	24373	24378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009641	TTA	2	6	24490	24495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009641	TTC	2	6	24527	24532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009641	CCA	2	6	24544	24549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009641	TCC	2	6	24551	24556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_009641	AAT	2	6	24588	24593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009641	ATTT	2	8	24597	24604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009641	TAT	2	6	24649	24654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009641	TCA	2	6	24668	24673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009641	CCG	2	6	24699	24704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009641	TAA	2	6	24713	24718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009641	A	6	6	24717	24722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009641	AT	3	6	24728	24733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009641	TA	3	6	24779	24784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009641	T	6	6	24853	24858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009641	A	6	6	24883	24888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009641	ATA	2	6	24896	24901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009641	TAA	2	6	29598	29603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009641	TCA	2	6	29619	29624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009641	T	6	6	29646	29651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009641	TAT	2	6	29664	29669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009641	TAA	2	6	29786	29791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009641	ATA	2	6	29860	29865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009641	AG	3	6	29950	29955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009641	GAC	2	6	30815	30820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009641	T	6	6	30833	30838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009641	TGT	2	6	30840	30845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009641	TGG	2	6	30846	30851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009641	TGT	2	6	30860	30865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009641	TTGA	2	8	30880	30887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009641	AAT	2	6	30897	30902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009641	AAT	2	6	30925	30930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009641	ATCA	2	8	30940	30947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009641	ATA	2	6	30967	30972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009641	AT	3	6	33326	33331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009641	ATA	2	6	33337	33342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009641	T	7	7	33377	33383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009641	A	7	7	33387	33393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009641	TAA	2	6	33437	33442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009641	A	6	6	33598	33603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009641	TAA	2	6	33612	33617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009641	TAA	2	6	33639	33644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009641	GGA	2	6	33677	33682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009641	A	6	6	34176	34181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009641	GAG	2	6	34190	34195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009641	ATA	2	6	34196	34201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009641	TGG	2	6	34219	34224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009641	TTCA	2	8	34239	34246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_009641	AT	3	6	34247	34252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_009641	AT	3	6	34256	34261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009641	AGT	2	6	34286	34291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009641	CTT	2	6	34355	34360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_009641	TTA	2	6	34368	34373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_009641	ATAA	2	8	34455	34462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009641	A	6	6	34479	34484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009641	ATA	2	6	34541	34546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009641	TTA	2	6	34560	34565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_009641	ATCA	2	8	34580	34587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_009641	T	6	6	34600	34605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_009641	AAT	2	6	34622	34627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_009641	TAA	2	6	34671	34676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009641	TTTTA	2	10	36461	36470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_009641	CA	3	6	36501	36506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
171	NC_009641	AGG	2	6	36512	36517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
172	NC_009641	TCC	2	6	36528	36533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_009641	TTA	2	6	36540	36545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_009641	TCA	2	6	37115	37120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_009641	TA	3	6	37133	37138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_009641	CATA	2	8	37150	37157	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
181	NC_009641	TAT	2	6	37175	37180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_009641	ATTA	2	8	38007	38014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_009641	TCA	2	6	38032	38037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_009641	GCT	2	6	38044	38049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_009641	TAA	2	6	38075	38080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_009641	CAT	2	6	38160	38165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_009641	TAA	2	6	38168	38173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_009641	T	7	7	38216	38222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_009641	AT	3	6	38265	38270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_009641	TAA	2	6	39449	39454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_009641	GTT	2	6	42146	42151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_009641	ATT	2	6	42281	42286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_009641	GTA	2	6	49183	49188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_009641	GA	3	6	57103	57108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
286	NC_009641	AATC	2	8	57910	57917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
287	NC_009641	ATA	2	6	57926	57931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_009641	AGA	2	6	57932	57937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009641	CA	4	8	58727	58734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
290	NC_009641	AAT	2	6	58769	58774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_009641	T	6	6	61094	61099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_009641	A	6	6	61120	61125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_009641	TGT	2	6	61143	61148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_009641	T	6	6	113915	113920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_009641	T	7	7	114874	114880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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